脊髓空洞症可以得到治療，一般建議給患者使用健腦，營養神經的藥物來進行治療，改善局部畸形的腦組織缺血缺氧的狀態。目前隨著手術技術的不斷改進，一般推薦採用後入路減壓手術的方式來進行治療。通過對於在顱頸交界處進行手術減壓，可以改善局部畸形以及缺血缺氧的病理狀態，消除致病的原因，從而有效的預防脊髓空洞症進一步發展與惡化。將脊髓空洞進行手術切除，並且做分流手術，從而使得之前原有存在的急性空洞逐步縮小，解除內在的壓迫。