脊髓空洞症一般以上頸髓和胸髓空洞最為常見，以小腦扁桃體下疝畸形為最主要的原因。在進行MRI檢查時，一般僅需做頸椎MRI平掃檢查即可，通常為400~600元；對於脊髓拴系綜合徵引起的脊髓圓錐部位空洞，需行腰骶椎MRI平掃，費用亦為數百元。對於個別與髓內腫瘤鑑別有困難者，可行頸椎MRI增強掃描，花費近千元。對於脊髓空洞範圍較廣，累及中胸段和腰骶段者，需要增加胸椎MRI和腰骶椎MRI，三個節段的脊柱MRI檢查費用共計2千元左右。