如果出現舌咽神經痛的症狀，首先要排除腫瘤、蛛網膜炎或動脈瘤等導致的可能，如果是由上述原因引起的，是要首先治療原發病。如排除上述情況，主要為止痛等對症治療，藥物方面首選卡馬西平，如效果不理想可用苯妥英鈉、氯硝西泮、加巴噴丁等；並可用Ｂ族維生素以營養神經治療；如果藥物治療無效，可行局部封閉治療或者手術治療。