男性尿路感染主要是由於致病微生物侵入泌尿系統而引起的炎症反應，病原菌包括細菌、真菌、支原體和衣原體等。
尿路感染根據感染的部位，可以分為上尿路感染和下尿路感染，上尿路感染比如腎盂腎炎和輸尿管炎，下尿路感染常見的比如膀胱炎和尿道炎，其中最常見的是腎盂腎炎和膀胱炎。腎盂腎炎指的是腎盂和腎實質的細菌性炎症，一般是由於病原體通過尿道進入膀胱，上行感染到達腎盂所引起，或者血行感染播散到腎盂所引起。