腎囊腫通常不會自己消失，單純性的腎囊腫是比較常見的腎臟良性疾病，也有一些腎囊腫可能跟遺傳具有一定關係，主要是指多囊腎。相對來說腎囊腫的發病機制目前並不十分清楚，大多數情況下可能由於腎小管憩室發展而來，多數腎囊腫沒有明顯的臨床症狀。
腎囊腫隨著年齡的增加，可能會進行性的增大，在嚴重情況下，囊腫也可以出現出血、腰痛，甚至引起血尿，較大的囊腫可以引起腎盂積水，合併感染可引起發熱及腰痛，在臨床上通過B超、CT、核磁可以進行診斷以及鑑別診斷。對於較小的腎囊腫，通常採用保守的治療方案，較大的囊腫可以考慮進行腎囊腫開窗術。