臨床上比較小的尿路結石可以選擇藥物排石，排石治療的適應症包括結石小於0.6cm，結石表面光滑，結石以下無尿路梗阻，結石未引起尿路完全梗阻，局部停留少於兩週。特殊成分如尿酸結石和胱氨酸結石，推薦採用排石療法。排石的方法主要是多飲水每天要保證2000mL以上的飲水量，保持晝夜均勻。
排石期間如果患者存在疼痛症狀，可以予以雙氯芬酸鈉栓劑肛塞。一些其他藥物可以用來輔助排石，如口服α1受體阻滯劑，如坦索羅辛或鈣離子拮抗劑。α1受體阻滯劑可以使輸尿管下段平滑肌鬆弛，促進輸尿管下段結石排出。一些中醫中藥也可以用於排石，如尿石通。還可以輔助以針灸療法，適當增加活動，根據結石部位的不同選擇體位排石。