腸結核最常見的臨床症狀，第一個就是腹痛，一般多見於右下腹部疼痛，因為腸結核好發於回盲部，第二個就是腹瀉與便秘，腹瀉是潰瘍型腸結核的主要臨床表現之一，另外，有時患者會出現腹瀉與便秘交替，第三個就是腹部包塊長位於右下腹部，一般位置比較固定，伴有輕度或者中度壓痛，第四個就是全身的症狀，往往表現為不同熱型的，長期的發熱，伴有盜汗，部分患者會有倦怠，消瘦貧血的表現。