腸結核最常用的檢查包括，一是血液檢查，比如血常規，第二大便常規檢查，可以見到少量膿細胞與紅細胞。第三是結核菌素實驗。第四，ct檢查可以見到腸壁環形增厚，第五就是電子結腸鏡檢查。結腸鏡可以對結腸和迴腸末段進行直觀觀察，如果病變主要在回盲部，鏡下可以見到病變的腸粘膜充血水腫，潰瘍形成。在鏡下還可以取組織活檢送病理。