目前對於陰莖短小唯一安全有效的方法就是手術治療。取適當位置切斷陰莖上的淺懸韌帶和深懸韌帶，使埋藏在體內的那段陰莖海綿體分離出來，採用內填外拔的縫合技術，使陰莖體外部分延長3-5釐米。對於陰莖勃起長度不足10CM的男性可以做這種手術。