胸腺瘤切除手術可以選擇離斷胸骨的胸腺瘤切除，也可以選擇胸腔鏡經胸腔胸腺瘤切除。如果選擇離斷胸骨的胸腺瘤切除，胸部切口較大，愈後局部可能形成較大的疤痕；再者，術中離斷胸骨，術後要固定胸骨，胸骨離斷後再固定，可能會導致愈後胸廓畸形。如果選擇胸腔鏡經胸腔胸腺瘤切除，需要打開胸膜腔，術後可造成胸膜腔粘連，使以後再行胸腔手術難度增大。