胸腺瘤的病因未明，只知道起源於胸腺上皮細胞或淋巴細胞的胸腺瘤最常見，絕大多數都是良性表現，一部分屬於惡性浸襲性發展。具體什麼原因引起胸腺瘤發展目前還處於研究階段，不除外遺傳基因因素。正常情況下胸腺會在成年後徹底退化消失，但是個別人會胸腺殘留，最終發生變化。另外環境因素，吸菸，飲食都有可能引起胸腺瘤。