胸腺瘤的治療原則是一經診斷即應外科手術切除。無論良性或惡性胸腺瘤都應儘早切除。良性胸腺瘤有惡變可能，惡性胸腺瘤會發生轉移，侵犯周圍組織。所以胸腺瘤一經發現都應該積極儘快考慮手術治療。切除的惡性胸腺瘤根據術後病理指導術後治療，部分切除者術後放射治療可緩解症狀，延長患者存活時間。另外胸腺瘤可能有重症肌無力的併發症，需要注意抗肌無力治療。