賁門失馳緩症最佳的治療辦法就是給予手術的治療，臨床上手術的治療有兩種，一種是內鏡下的微創治療，一種是外科的手術切除賁門治療，前者內鏡下的治療是目前比較推崇的一種辦法。主要是在食管上段距門齒25釐米處，給予黏膜下鑽孔隧道法，剝離黏膜下層達到賁門口，然後切除賁門口的固有肌層，最後封堵創面。是目前解決賁門失馳症的最佳辦法，具有創傷小、恢復快、效果比較好等特點。