一般來說，體積小的腺肌瘤常常沒有臨床症狀，也不需要治療，長期隨診觀察即可。絕經之後雌、孕激素顯著下降，腺肌瘤會逐漸萎縮，有時腺肌瘤體積較大、增長較快，不能除外惡性變需要手術治療。有時腺肌瘤有明顯的臨床症狀，比如痛經嚴重無法耐受或者引起不孕，或者引起月經量過多導致貧血也需要手術治療。手術方式包括腺肌瘤剔除以及子宮切除兩類，腺肌瘤剔除一般用於保留生育能力者，子宮切除一般用於不需要保留生育能力者。