巧克力囊腫3期已經是巧囊比較高的級別了，雖然為良性病變，但是也已經影響女性生殖健康及生活質量，是中等嚴重程度疾病。巧囊隨著病情發展，會出現輕微破裂，囊液流出至盆腔各個部位隨之種植，隨著月經次數增多，種植病灶逐漸發展，引發盆腔廣泛黏連、盆腔痛、痛經、性交痛，輸卵管變形失去功能，繼發不孕或宮外孕，所以巧囊一經發現應及時治療。