羊水穿刺時如果沒有麻醉，在穿刺針穿透皮膚時會有輕微疼痛，都可以忍受。如果有麻醉，一般局部麻醉，打麻藥時會有輕度疼痛，之後就不會有明顯疼痛。羊水穿刺，疼痛不是主要問題。有個別人羊水穿刺後會出現流產，這是主要需要擔心的地方。當然絕大部分不會出現流產，流產發生率一般＜1%-2%。羊水穿刺後如果出現宮縮，出現陣發性腹痛，或者伴有陰道出血，要及時就診看醫生，做B超檢查以除外胎盤後血腫、流產等特殊情況。