多囊卵巢綜合徵是一種慢性的、代謝性的疾病，就如同高血壓糖尿病一樣，在不同的年齡會有不同的健康影響。對於育齡期的女性，多囊卵巢綜合徵最大的問題，可能會導致排卵異常，導致不孕症的發生。懷孕之後多囊卵巢綜合徵患者流產率也會增高，像妊娠期糖尿病和妊娠期高血壓疾病的風險也會增加，同時圍產期其他併發症的風險也隨之增加。多囊卵巢綜合徵完成生育之後本身的併發症，比如肥胖、血糖異常可能會引起糖尿病、心血管疾病，比如動脈粥樣硬化導致冠心病、高血壓，同時子宮內膜長期的雌激素刺激會增加子宮內膜癌的風險。所以多囊卵巢綜合徵是慢性病，需要長期的健康管理。