要明確新生兒黃疸分為生理性黃疸和病理性黃疸，生理性黃疸通常不需要特殊的治療，通過加強餵養，促進寶寶多吃、多排，足月的寶寶生後7-10天黃疸可以自然消退。如果是早產的寶寶，大多生後3-4周黃疸也可以自然消退。對於病理性黃疸，最有效的治療是光療、藥物治療和換血治療為主，並且積極治療原發病。
病理性黃疸採取光療，最常用的是藍光照射治療，可以促進非結合膽紅素的排洩，是比較常用的方法。另外還有藥物的治療，藥物的治療常用的是補充白蛋白，結合遊離膽紅素，降低血液中膽紅素的水平。另外還可以服用肝酶誘導劑，比如說苯巴比妥，可以誘導肝酶活性，促進肝臟對非結合膽紅素的代謝。最主要的還是換血療法，如果孩子出現了重度的溶血癥，或者嚴重的敗血症，懷疑有核黃疸嚴重的情況下，最快的治療方法是換血治療。