新生兒敗血症的治療措施視病情而異，應強調綜合措施。一、抗生素的治療：疑似新生兒敗血症的患兒，在細菌學檢查結果未報告以前根據病史和臨床特點，先開始經驗治療。考慮革蘭氏(+)細菌感染，首選青黴素和頭孢一代二代抗生素;對金黃色葡萄球菌過敏可選用苯唑西林。對於耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌和耐藥肺炎球菌的嚴重感染選用萬古黴素。早產兒和腎功能不好者使用萬古黴素要慎重，需要監測血藥濃度。一旦血培養得到(+)結果，根據藥物敏感試驗及已有的治療效果，決定是否需要調整抗生素。二、生物免疫治療：對一些重症感染的患兒尤其是早產兒嚴重感染，除了使用抗感染的藥物以外，還可以使用免疫輔助治療，以增強機體的抵抗能力，常用的藥物為靜脈用丙種球蛋白。三、保持循環穩定。四、維持機體酸鹼、水電解質平衡。