幼兒川崎病如果出現了心肌炎和冠狀動脈血管炎，影響到了心臟，那麼對患兒以後是有很大影響的。一旦形成了動脈血管瘤或者是動脈炎導致的冠狀動脈鈣化、閉塞或者狹窄，會影響心肌供血，通常可能會誘發心肌梗死以及心功能障礙，會影響患兒以後的生長發育以及生存。而對於動脈瘤，一旦出現破裂，就可能會危及患兒生命。但對於沒有出現心臟病變的患兒來講，大多數預後比較好。