不育症男性首先要檢查精液常規，因為生育，男性最主要的就是依靠精子，因此精液常規是最基本也是最重要的檢查之一。通過精液常規來了解精子的質量，比如精子密度，精子活力，還有正常形態率。還可以再檢查精液有沒有感染白細胞，如果精液質量正常，其它檢查暫時可以不用做。
如果精液質量不正常，需要根據不正常的原因再深入進行檢查，比如少精子症，可以繼續做B超，瞭解有沒有精索靜脈曲張，也可以進行染色體的檢查，比如Y染色體微缺失，染色體核型，還有性激素檢查，瞭解男性激素水平。對於反覆胎停和流產的夫婦，男性還可以做精子功能的檢查，比如精子DNA碎片率，目前認為精子DNA碎片率可能會影響到男性正常受孕和胚胎的質量。