導致畸形精子症的原因包括了以下幾個方面：首先，最常見的是生殖道微生物感染，比如支原體、衣原體等導致的附睪炎等；其次，出現精索靜脈曲張可引起睪丸溫度升高，睪丸生精功能和附睪精子成熟功能障礙；再者，遺傳學因素也可能是引起精子畸形率升高的重要原因，比如染色體核型異常，染色體多態性等；最後，環境汙染、吸菸飲酒熬夜等不良生活習慣、接觸高溫化學放射性物質等也是導致精子畸形率升高的重要因素。