慢性咽炎主要是病因治療以及藥物治療，病因治療包括戒除抽菸喝酒等不良習慣、需要積極治療鼻炎以及上呼吸道的慢性炎症。藥物治療包括應用呋喃西林溶液漱口，可以應用納米銀口腔噴劑或是快必舒咽部噴入，可以含化銀黃含化片、草珊瑚含片、西瓜霜含片，口服各種中成藥，如百合固金顆粒、炎熱清膠囊等。慢性肥厚性咽炎除上述治療外還可以應用激光、冷凍、低溫等離子消融淋巴濾泡治療。