口腔潰瘍經常發作原因和不同的類型有關，常見的有以下幾點：
1、複發性阿弗他潰瘍，目前病因不清，學說眾多，沒有統一的意見，但是國內外的絕大多數學者，通過研究認為可能和免疫因素、遺傳因素、系統性疾病、細菌感染，以及地理環境、人文環境、營養環境等有關，比如有的人細胞免疫障礙、體液免疫障礙，還有家族性的遺傳傾向病人，或者有胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎，都可以伴發口腔潰瘍。
2、創傷性的潰瘍，往往是局部有機械刺激因素，反覆的損傷口腔黏膜而引起潰瘍，常見的局部有殘根、殘冠、不良修復體，以及尖銳的牙尖、邊緣嵴。