部分心肌緻密化不全屬於先天性疾病，這種疾病目前沒有辦法完全治療好，臨床上主要是對症處理。有相當一部分的心肌緻密化不全患者需要在中年甚至老年才發病，和心肌緻密化不全的累及範圍有關，在沒有發病之前可以不做處理。如果有引起臨床症狀，比如說心律失常，可以抗心律失常治療。如果有引起心力衰竭，可以對症選擇利尿劑，強心劑。如果有合併其他心臟畸形，也可能需要手術治療。