肺結核相對比較好治療，針對肺結核有以下幾種方案，對於初治的肺結核，採用標準化治療方案，對新病例其方案分兩個階段，即兩個月強化期和4-6個月鞏固期，強化期通常聯合用3-4個殺菌藥，鞏固期可以用兩種殺菌藥，而對於復陽的肺結核，推薦強化期五個藥和鞏固期三個藥的聯合方案，強化期至少有兩個仍然有效的藥物，療程需適當的延長。
對於耐藥的肺結核，有條件時，儘量做藥敏試驗，沒有條件的情況下可以根據用藥史進行評估，一般強化期選用4-5種藥物，至少包括三種從未試過的藥物或者仍然敏感的藥物，如吡嗪酰胺、卡那黴素、對氨基水楊酸鈉、氟喹諾酮類藥物等，強化期治療至少三個月，鞏固期減至2-3種藥物。