肺結核容易復發。由於肺結核病程較長，在治療過程中如果不正規用藥，患者就容易復發或者耐藥，患者復發之後症狀及影像學可以加重，這種情況需要根據復治塗陽肺結核的治療方案進行治療。
復發的肺結核要進行藥物敏感試驗，如果是藥物敏感的患者，可以給予強化期兩個月，鞏固期6-10個月。鞏固期治療四個月痰菌未轉陰，可以延長治療期6-10個月。如果藥物敏感實驗為耐藥肺結核，需納入耐藥肺結核治療方案，耐藥肺結核一定要嚴格避免只選用一種新藥加入到原失敗方案當中，儘量要採用新一代喹諾酮類藥物，不使用交叉耐藥的藥物，治療方案當中至少含四種二線的敏感藥物，加強期為9-12個月，總治療期為20個月或者更長，以治療效果決定停藥時間。