正規的抗結核藥物治療才能使結核好的更快，抗結核藥物治療原則是早期、規律、全程、適量、聯合，整個治療方案分強化階段和鞏固階段。對於初治活動性肺結核方案包括強化期四種藥物，鞏固期兩種藥物。對於復治塗陽的肺結核的治療方案，要進行藥敏試驗，根據藥物的敏感試驗進行治療，一般強化期五種藥物，鞏固期三種藥物。
對於耐藥性肺結核的治療方案是詳細是詢問病人的用藥史，然後根據藥敏試驗選擇用藥，一般在治療方案當中至少還有四種二線的敏感藥物，至少包括吡嗪酰胺、氟喹諾酮類、注射用硫酸卡那黴素和阿米卡星、丙硫異煙胺、環絲氨酸等，劑量根據體重決定，治療效果決定治療時間。