肥厚型心肌病在疾病的後期出現左心室擴大，左心室收縮功能減低、慢性心功能不全的表現，可以針對性對心力衰竭進行治療，治療藥物的選擇與其它原因引起來的心力衰竭相同。一、利尿劑，它是心衰治療中改善症狀的藥物基石，在慢性心力衰竭急性發作和伴有明顯的體液瀦留時候使用，包括有呋塞米；使用時候注意監測血鉀；氫氯噻嗪，一般和保鉀利尿劑一起用，但是痛風的患者不建議使用；保鉀利尿劑：螺內酯，氨苯蝶啶。二、ACEI類，它可以延緩心衰進展，從小劑量開始，如果能耐受可以加量，可以長期終身服用。三、ARB類，當有ACEI類引起的刺激性乾咳的時候換用此藥物。四、β受體拮抗劑，它可以減輕症狀、改善預後、降低死亡率。五、正性肌力藥物，洋地黃類藥物。