肥厚型心肌病分為梗阻性肥厚型心肌病和非梗阻性肥厚型心肌病。對於肥厚性梗阻性的那種心肌病，往往出現在流出道的壓力的壓差增大，梗阻嚴重，這樣的患者需要積極用藥治療，可以吃Ca+2拮抗劑和β受體阻滯劑，對於壓力階差特別高的患者，需要行化學消融或射頻消融的方法，解除流出道的梗阻。對於這樣的患者，也可以採用外科治療的方式，切除部分室間隔，改善流出道梗阻的程度，減輕症狀，減少猝死的風險。一部分患者可以植入心電起搏的起搏器，也有一定程度的改善流出道壓力的作用。對於非梗阻型的肥厚型心肌病，往往是用藥為主，一部分患者也可以採用外科手術治療的方法，但是這樣的患者不適合做化學消融或者是射頻消融，解除肥厚。對於有明確惡性心律失常的患者需要植入ICD。