肥厚型心肌病減輕左心室流出道梗阻可以選用β受體阻滯劑，是它的一線治療藥物，還可以選用非二氫吡啶類鈣拮抗劑，但一般不建議聯合使用。心力衰竭的治療，可以選擇鈣離子拮抗劑，β受體阻滯劑，利尿劑和螺內酯，甚至地高辛等，要注意藥物的適應症和禁忌症，最常見的心律失常是房顫，胺碘酮能減少陣發性房顫的發作，對持續性房顫可選用β受體阻滯劑。