在肥厚性心肌病患者的心電圖檢查中有部分患者可以出現異常Q波，多見於ll，lll，avF，V5及V6導聯，有時在V1及V2導聯出現深Q波及高R波，呈QR型。伴有ST-T繼發改變，呈下向性單向曲線，經治療後Q波可以消失。異常Q波是由於肥厚性室間隔產生的除極向量異常增大導致的，這種心電圖變化可以消除和再次出現，這些與心肌梗塞是不同的。