腦炎主要指病原感染腦實質，以病毒感染為主，臨床表現較腦膜炎嚴重，除了發熱、嘔吐、頭痛。還會伴有肢體癱瘓。腦脊液特點為：外觀清亮，壓力正常或增加，白細胞數正常或輕度增多，蛋白含量大多正常或輕度增高，糖含量正常。腦膜炎是指病原主要感染腦膜，以細菌感染為主，多不伴有肢體癱瘓。腦脊液特點為：壓力增高、外觀渾濁似米湯樣，白細胞總數顯著增多，分類以中性粒細胞為主，糖含量明顯降低，蛋白含量顯著增高。