小兒中毒性腦病和小兒病毒性腦炎區別主要是病因、症狀等方面的不同。從病因方面來說中毒性腦病是因為毒素進入大腦導致腦細胞受到損害引起的；而病毒性腦炎多數是因為受到腸道病毒等感染導致的。從症狀方面來說，病毒性腦炎早期症狀主要是發熱感染症狀起病，而中毒性腦病早期症狀通常有頭痛，頭暈，嗜睡等。但不管是哪一種疾病，確診之後都應該要儘早做治療。