重度病毒性腦炎大部分可在兩週內恢復，部分會產生一些後遺症，如癲癇、視力障礙、肢體癱瘓、腦萎縮、脫髓鞘或智力遲緩等症狀。這種病是病毒侵犯腦實質引起的腦部症狀，大部分患者有發熱、反覆驚厥發作的臨床表現，嚴重者還有偏癱、單癱、四肢癱的現象發生。本病主要是判斷病因，對於營養不良的患者及時注射靜脈營養劑或白蛋白，給予一些抗病毒藥物，如丙氧鳥苷和無環鳥苷。