化膿性腦膜炎最常見的併發症，是急性瀰漫性腦水腫導致的顱內壓增高，甚至腦疝。化膿性腦膜炎病情嚴重，進展迅速，如果脫水降顱壓的治療方法不及時或藥物劑量不夠，或者病人病情過於危重，可能會因為急劇增高的顱內壓而出現腦疝的表現，病人可能會因此而出現呼吸、心跳驟停而導致死亡。另外化膿性腦膜炎的膿性滲出物，容易使腦室孔發生粘連，導致腦脊液循環障礙而出現腦積水。化膿性腦膜炎的患者還會因為劇烈的嘔吐、進食差，而出現內環境的紊亂，常見水電解質的紊亂。化膿性腦膜炎病人還會併發癲癇，癲癇呈持續狀態。如果是爆發型的流行性腦炎，還會容易伴發DIC和休克等。