腦囊蟲病的原因最常見是外源性感染，是人體攝入帶有被豬絛蟲的蟲卵汙染的食物，或因不良的生活習慣是蟲卵被攝入人體內治病，極少見的是內源性的感染即肛門-口腔轉移形成的自身感染。腦囊蟲病自感染到出現症狀，數日至30年不等，常常與囊蟲囊蟲的數量，大小和感染部位有關。如果是在腦實質才表現為突然的，或者緩慢出現的偏癱、感覺缺失、偏盲和失語；如果侵犯的是蛛網膜或腦室病情比較重，常因腦積水、顱內壓的增高合併意識障礙，甚至死亡。