中毒性菌痢多見於2-7歲兒童，起病急驟、高熱，全身中毒症狀明顯，臨床上可表現為感染性休克和中毒性腦病。病初腸道症狀輕或缺如，做肛拭子檢查可發現黏液膿血便。中毒性菌痢的治療原則是降溫止痙、解除血管痙攣、防治休克、腦水腫以及抗菌藥物的應用。高熱可引起驚厥而加重腦缺氧和腦水腫，故應積極給予物理降溫，必要時給予退熱藥，如安乃近，將體溫降到38℃以下。還要給予抗休克的治療，主要是擴充血容量、糾正酸中毒、改善微循環、保護重要的臟器的功能。還要糾正呼吸衰竭，呼吸衰竭的發生與腦微循環障礙所致的腦缺氧、腦水腫有關。還要給予抗菌的治療，藥物的選擇基本與急性菌痢相同，但要先採用靜脈給藥，可用左氧氟沙星、環丙沙星和頭孢曲松等，病情好轉之後，改為口服藥物。