肺膿腫治療原則是抗炎和引流，肺膿腫是由細菌感染導致的，最常用的是青黴素靜脈輸液治療。脆性類桿菌可以用林可黴素，甲硝唑治療。軍團菌感染導致的可以用紅黴素，阿奇黴素治療。肺膿腫的患者痰液比較多，痰液粘稠的可以做霧化吸入治療。慢性的肺膿腫，支氣管癌患者感染不容易控制，伴有大量咳血有生命危險時可以做外科手術治療。