十二指腸潰瘍疼痛部位主要為上腹部或劍突下出現燒灼痛或鈍痛，進餐後3-4小時出現,為飢餓痛、空腹痛或夜間痛，此時若服用抗酸藥物或吃些食物能使疼痛緩解或停止。肚臍偏右上方可有壓痛。腹痛具有週期性發作的特點，一般秋冬季和冬春季好發。每次發作時症狀可持續幾周後緩解，間歇1～2個月再復發。如果緩解期縮短，發作期延長，腹痛程度加重，那麼提示潰瘍病變加重。