不同的甲狀腺炎臨床症狀不一樣，比如像亞急性甲狀腺炎是病毒相關性的自限性疾病，是由於抵抗力下降，病毒乘虛而入。可以表現為發熱，經常是午後或者是夜間明顯的體溫到了38℃，甚至39℃，明顯出現感冒樣的症狀，乏力、睏倦、渾身痠軟沒勁。主要還包括頸部的疼痛，部位可以由一側便換到另外一側，可以出現頸部痛性的包塊。醫生檢查查體的時候發現甲狀腺腫大，還可以出現明顯的觸痛。醫生進行甲狀腺激素水平測定，可以出現甲狀腺激素明顯的增高、血沉的加快、甲狀腺超聲提示片狀低迴聲、甲狀腺掃描可以不顯影、吸碘率明顯降低。經過休息和適當的用藥都能夠完全治癒，很少遺留終身性的甲減。
另外，像橋本氏甲狀腺炎或者是產後甲狀腺炎，可以出現甲狀腺功能的異常，可以出現一過性甲狀腺激素水平增高，表現的是甲亢，怕熱、多汗、手抖、心慌、體重下降、多食易飢；也可以出現一過性的甲狀腺功能減退，怕冷、浮腫、體重明顯輕增加，另外是睏倦、不想吃飯、記憶力下降。橋本氏甲狀腺炎和產後甲狀腺炎，往往沒有明顯的甲狀腺局部的疼痛，也沒有發熱，醫生根據甲狀腺功能狀態進行相應的治療。不同的甲狀腺發炎，症狀往往不一樣。