亞急性甲狀腺炎是一種自限性疾病，病程大概3-4個月，期間可能會反覆發作。發作時大多會有甲狀腺區疼痛、發熱的症狀，一般應用非甾體抗炎藥，如消炎痛、布洛芬等，如果疼痛厲害，可能需要口服激素治療，這需要在醫生指導下用藥，然後逐漸減量、停藥。少部分病人可能會有一過性心動過速、心悸、出汗等甲亢症狀，一般情況不需要處理，症狀嚴重的可以短期口服普萘洛爾治療。