有一部分腸息肉可以遺傳，在腸道、胃內、腸內均有大量息肉，稱為家族性息肉病或幼年性息肉病等。腸道里多發息肉通常較為頑固，比如腺瘤性息肉，如果存在家族史，則存在發展成腺癌的風險，因此要定期複查、隨訪，發現息肉及時切除，而遺傳因素導致的息肉很難預防。

部分息肉沒有遺傳因素，如單發的炎症性息肉，可能是長期大便秘結、宿便刺激導致腸道炎症並出現息肉。而非遺傳因素的息肉單發較為常見，即使多發，一般也不超過10％。通過飲食調控和中藥的治療，保持良好的排便習慣，能夠預防息肉的復發。