結腸鏡下進行息肉切除手術，麻醉情況下不會疼痛，因為黏膜本身通過高頻電流切割以後，時間較短。但是腸鏡本身如果在非麻醉狀態下，會因為鏡子推送引起疼痛。

因此，臨床中通常建議腸鏡下息肉摘除最好在無痛麻醉狀態下進行操作。靜脈麻醉時處於較淺昏睡狀態，感覺較為遲鈍，沒有痛感。在此狀態下進行有創操作，可在20-30分鐘內完成手術，過程當中完全沒有感覺，即沒有痛苦。