兒童輕度肥胖並不影響智力，如果兒童出現明顯肥胖，對智力有所影響。明顯肥胖的孩子紅細胞濃度過高，容易導致血液黏稠度過高。此外，明顯肥胖的孩子還容易出現夜間睡眠呼吸暫停綜合徵，容易出現睡眠時低通氣綜合徵，導致低氧血癥，睡眠質量較差，因為長期處於低氧血癥狀態中，生理機能並不能得到完全修復，第二天孩子上課或者活動會出現疲倦狀態。

此外，明顯肥胖兒童與正常體重兒童相對比，行為協調能力、動作協調能力明顯偏差。另外，肥胖孩子在精神心理方面容易出現自卑、抑鬱、焦躁等，導致出現性格孤僻等表現，也會影響自信心，進而對智力發展不利。