原發性中樞神經系統淋巴瘤是較罕見的腦腫瘤，此類腦腫瘤容易形成周圍大面積水腫，引起患者出現間歇性顱內壓增高。因此患者臨終前主要表現為進行性加重的顱內壓增高，引起患者出現明顯的頭痛、噁心及噴射性嘔吐。由於腫瘤所在部位不同，患者可能出現進行性加重的肢體無力，乃至偏癱和癲癇發作，部分患者會出現視野缺損。

中樞神經系統淋巴瘤的患者，有時會出現較典型的特徵性表現，即進行性加重的智力障礙、痴呆及精神症狀。雖然膠質瘤和腦轉移瘤等患者可能會出現此類症狀，但原發性中樞神經系統淋巴瘤患者出現此類症狀的時間更早，並且可能貫穿治療全過程。隨著病情進展，患者出現進行性意識障礙加重，最終導致昏迷、瞳孔散大、腦疝和心跳呼吸驟停，從而危及生命。