如果患者出現噁心、嘔吐或者神經症狀，CT檢查懷疑是原發性中樞神經系統淋巴瘤，最好的確診辦法為手術後進行病理檢查，不僅可確診，且可進行分級、分型，病理檢查是診斷原發性中樞神經系統淋巴瘤的金指標。

如果手術有一定困難，不能進行外科手術，可進行立體定向穿刺，取淋巴組織進行病理診斷。確診原發性中樞神經系統淋巴瘤必需取病理組織明確診斷，也利於與其它中樞神經系統腫瘤相鑑別，如腦膠質瘤等。