鼻咽癌最常見轉移部位是頸部淋巴結。初治鼻咽癌大概70%患者就診時已經伴有頸部淋巴結轉移，而且大概1/3病人以頸部淋巴結腫大就診，檢查後診斷為鼻咽癌，所以頸部淋巴結是鼻咽癌最常見轉移部位。鼻咽癌在整個發病過程中，大概20%患者會出現血行轉移。

血行轉移最常見部位是骨骼，骨骼以腰椎最常見，其次轉移部位依次是肺、肝。鼻咽癌在隨訪過程中要做相應檢查，一旦發現這些部位轉移，要做到早治療、早處理。