鼻咽癌原因世界衛生組織可以分成三大類，其中真正跟病因直接相關的可能是兩大類，一類是跟菸酒相關，稱為Ⅰ型鱗癌；另一類跟EB病毒相關，稱為Ⅱ型；Ⅲ型則非常少見。Ⅰ型主要是菸酒引起，如果菸草、白酒，特別是烈性酒的消耗量大，鼻咽癌出現的概率會比較高，但是在國內比較少，主要發生在歐美國家。國內最常見的或90%-95%的類型都與EB病毒相關，其中易感EB病毒的因素如下：

1、人種，主要為東南亞人種；

2、喜食鹹魚、鹹菜。

EB病毒感染率非常高，基本上在90%以上。EB病毒感染以後，病毒潛伏在鼻咽部的黏膜，隨著病毒的慢慢複製會導致黏膜上皮的癌變。