胰腺囊腺瘤手術的指徵並沒有非常公認的標準，不同的胰腺外科醫生會有不同的判斷，總的來說，腫瘤的體積是重要的指徵，腫瘤直徑大於6cm建議手術切除。在臨床影像學診斷當中，如果能夠判斷病人的腫瘤不大，又是漿液性囊腺瘤相應的表現，建議定期觀察、臨床密切隨診。隨診的過程當中，腫瘤有增大的趨勢，或者腫瘤的表現侵襲周圍器官，或者出現了囊壁結節等表現，也要進行及時的手術。黏液性囊腺瘤，一經發現建議手術，黏液性囊腺瘤有惡變的傾向。臨床單從影像學上有的時候也不是特別容易鑑別，如果不容易鑑別、腫瘤體積有增大的趨勢，手術指徵可以適當放寬。